Johnny Flynn, 14 Mart 1983 tarihinde Güney Afrika’nın Johannesburg kentinde dünyaya geldi. Babası İngiliz tiyatro oyuncusu Eric Flynn, annesi ise Caroline Forbes’tur. Henüz üç yaşındayken bir Staffordshire Bull Terrier saldırısına uğrayan sanatçının yüzünde, bu olaydan kalan belirgin yara izleri oluştu. Dört yaşındayken ailesiyle birlikte İngiltere’ye taşındı. Müzik yeteneği sayesinde Winchester’daki Pilgrims School’a şapel korosu bursuyla kabul edildi ve burada keman ile trompet çalmayı öğrendi. Daha sonra kendi kendine gitar çalmayı öğrenen Flynn, müzik bursuyla Bedales School’a geçti. Oyunculuk eğitimini ise Webber Douglas Dramatik Sanatlar Akademisi’nde tamamladı. Sanatçı bir ailede yetişen Flynn’in üvey ağabeyleri Jerome Flynn ve Daniel Flynn de oyuncudur. Kız kardeşi Lillie Flynn ise müzik çalışmalarında kendisine eşlik ederek grubunda vokalistlik yapmaktadır.

Oyunculuk kariyerinin yanı sıra müzisyen kimliğiyle de tanınan Flynn, geleneksel folk müziğini modern indie rock unsurlarıyla birleştiren Johnny Flynn & The Sussex Wit grubunun solistidir. Şarkı sözlerinde edebiyat, mitoloji ve doğadan sıkça yararlanan sanatçı, yazar Robert Macfarlane ile ortak müzik projeleri de gerçekleştirdi. İlk stüdyo albümü A Larum‘u 2008 yılında yayımlayan Flynn, ardından Been Listening (2010), Country Mile (2013) ve Sillion (2017) albümlerini çıkardı. Robert Macfarlane ile hazırladığı Lost in the Cedar Wood (2021) ve The Moon Also Rises (2023) albümleriyle müzikal çalışmalarını sürdürdü. Kız kardeşi Lillie Flynn ile birlikte hazırladığı Beam Cottage ise 2026 yılında yayımlandı. BBC’nin komedi dizisi Detectorists için bestelediği ve seslendirdiği tema müziği, sanatçının en bilinen çalışmalarından biri hâline geldi.

Flynn’in oyunculuk kariyerinde tiyatronun önemli bir yeri bulunuyor. Shakespeare’in Twelfth Night oyununda Globe Theatre sahnesinde Viola karakterini canlandırdı ve bu performansıyla Ian Charleson Ödülleri’nde özel övgüye layık görüldü. Royal Court Theatre’da sahnelenen Jerusalem oyunundaki performansıyla Olivier Ödülleri’nde En İyi Yardımcı Erkek Oyuncu kategorisinde aday gösterildi. New York’taki Hangmen yapımındaki performansıyla Theatre World Award kazanan oyuncu, West End sahnesinde sergilenen True West oyununda başrolü üstlenmesinin yanı sıra oyunun müziklerini de besteledi. 2023-2024 yıllarında National Theatre’da sahnelenen The Motives and the Cues oyununda Richard Burton’ı canlandırdı. Tiyatro sahnesindeki çalışmaları, oyunculuk kariyerinin temel taşlarından biri oldu.

Televizyon ve sinema projelerinde de farklı karakterlerle izleyici karşısına çıkan Flynn, 2014-2018 yılları arasında yayımlanan romantik komedi dizisi Lovesick‘te Dylan Witter karakterini canlandırarak geniş kitlelerce tanındı. 2017 yılında Genius dizisinde genç Albert Einstein rolünü üstlendi ve bu performansıyla Critics’ Choice Ödülleri’nde adaylık elde etti. 2020 yapımı Emma. filminde George Knightley karakterini canlandırarak Anya Taylor-Joy ile başrolü paylaştı. Aynı yıl yayımlanan Stardust filminde David Bowie’nin gençlik yıllarına hayat verdi. 2021’de Netflix yapımı The Dig filminde Rory Lomax, Operation Mincemeat filminde ise James Bond karakterinin yaratıcısı Ian Fleming rolünde yer aldı. 2023 yapımı One Life filminde genç Nicholas Winton’ı canlandıran Flynn, 2024 yılında yayımlanan Ripley dizisinde Dickie Greenleaf karakteriyle izleyici karşısına çıktı.

Flynn, oyunculuk ve müzik alanlarındaki çalışmalarıyla çeşitli ödüller kazandı ve adaylıklar elde etti. Twelfth Night performansıyla 2012 Ian Charleson Ödülleri’nde özel övgü alan sanatçı, Jerusalem ile Olivier Ödülleri’ne aday gösterildi. Hangmen oyunundaki performansı sayesinde 2018 Theatre World Award’ı kazandı. 2021 yılında Magnitsky the Musical adlı radyo yapımıyla BBC Audio Drama Awards kapsamında ödüle layık görüldü. Müzik ve oyunculuğu bir arada sürdüren Flynn, tiyatrodan televizyona, sinemadan müzik sahnesine uzanan çok yönlü kariyeriyle tanınmaktadır.